Нико Попов е роден в Бургас на 12 януари 1837 г. в семейството на иконом поп Никола и презвитера Елена 
, завършва местното гръцко училище. Пътува до Русия и Цариград, но не се знае, дали там е продължил образованието си. Владеел е много добре, писмено и говоримо гръцки и турски език. На 06. 02. 1878 г., ден след Освобождението на гр. Бургас Нико Попов е избран за първи кмет на новоучредената бургаска община. На тази длъжност остава до август 1880 г.
Като кмет Нико Попов се отличава с изключително трудолюбие и усърдие в работата си. За грижите, които проявява към пребиваващите в Бургас руски войски, е награден от Сливенския губернатор с бронзов медал. Благодарение на него на мястото, където са посрещнати руските освободители, е построен скромен мраморен паметник.
